Ю.Д. Кудаков является одним из наиболее авторитетных ученых в вопросах формирования музыкально-эстетической культуры школьников средствами чувашского народного творчества. Научная новизна исследования Ю. Д. Кудакова заключается в том, что в ней впервые широком плане определено место чувашской народной песни в системе средств формирования эстетической культуры школьников; дана классификация чувашских народных песен и возможность их использования в школьном учебном процессе; разработана модель непрерывного музыкального образования и программа подготовки студентов к использованию чувашского народного песенного творчества; разработаны критерии готовности учителей к осуществлению данной программы.
Ю.Д. Кудаков издал более 200 научных и методических трудов. Из них большую практическую значимость имеют 18 учебных пособий, 3 монографии, 5 методических разработок и рекомендаций, 2 хрестоматии и 5 учебных программ для студентов, а также статьи, опубликованные в центральной печати – в журналах «Музыкальная академия», «Народник» и республиканской печати.
Ю.Д. Кудаков – член Ассоциации композиторов Чувашии. К становлению и развертыванию деятельности этого творческого союза он имеет прямое отношение. В 1981-1988 гг. Юрий Дмитриевич являлся председателем бюро секции чувашских композиторов, в 1988-1990 гг. – заместителем председателя, а с переформирования ее в Ассоциацию композиторов Чувашии – творческого союза до 1997 г. – вице-президентом этой организации. В настоящее время исполняет обязанности члена Совета Ассоциации и члена Президиума Музыкального Общества Чувашии.
Музыкальное творчество Ю.Д. Кудакова отражает традиции чувашской народной песни и особенности чувашской национальной культуры, воспитывает почтительное отношение к Родине.
Он является автором музыки более 800 сольных и хоровых песен на стихи чувашских и русских поэтов; более 70 песен для детей; более 40 инструментальных сочинений; им создана музыка к 35 театральным постановкам; гимнам, в том числе Шумерлинского, Аликовского района и Комсмольского районов Чувашской Республики и др.
С 1979 года Ю.Д. Кудаков работает над созданием музыки к спектаклям для Чувашского академического драмтеатра им. К. В. Иванова, театра оперы и балета Чувашской Республики, Чувашского государственного театра юного зрителя им. М. Сеспеля и театра кукол. Из 35 спектаклей, написанных для чувашских театров, 13 являются музыкальными комедиями.
Ю.Д. Кудакову присвоено почетное звание «Заслуженный работник культуры Чувашской Республики». Награжден знаком «Отличник культурного шефства над селом» Министерства культуры СССР и ЦК профсоюза работников культуры (1980 г.).
Кудакову Ю.Д. присуждена премия молодежи им. М. Сеспеля . Ему присуждено также почетное звание «Заслуженный деятель музыкального общества Чувашской Республики» (1995 г.).
В 2014 году за большие заслуги в развитии отечественной культуры и искусства, телерадиовещания, печати, связи и многолетнюю плодотворную деятельность Юрию Кудакову Указом Президента РФ Владимира Путина было присвоено почетное звание «Заслуженный работник культуры Российской Федерации».